Genomica
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El objetivo principal de la Unidad de Genómica del IPBLN es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica.
La UGIPBLN apuesta por la excelencia en la investigación biomédica. Por ello hemos establecido un sistema de gestión de la calidad y estamos involucrados en un proceso de certificación, con el fin de que nuestros servicios cumplan con los máximos estándares de calidad científica. Para saber más consulta nuestra Carta de Compromiso de Calidad:
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Objetivos
Instalaciones
Laboratorio de produccion de librerias NGS
Sala de secuenciadores NGS
Laboratorio de secuenciacion Sanger
Sala de real time PCR y digital PCR
Equipamiento
3130XL Genetic Analyzer:
Secuenciador 3130xl de Applied Biosystems de 16 capilares.
ABI 7000 SDS:
Equipo de PCR a tiempo real con bloque de 96 pocillos.
COVARIS M220:
Ultrasonicador focalizado para fragmentacion de moleculas
MiSeq:
Equipo de secuenciacion masiva low-throughput de tecnologia Illumina.
NextSeq 500:
Equipo de secuenciacion masiva high-throughput de tecnología Illumina
Qiacube:
Plataforma para la purificación automatizada de ácidos nucleicos.
Qubit:
Fluorímetro.
HT7900 Fast Real-Time PCR System:
Equipo de PCR a tiempo real y estación de genotipado con bloques intercambiables de 384 pocillos y TLDAs.
Gene Amp 9700 PCR System:
Termociclador convencional con bloque de 96 pocillos.
T-100 PCR:
Termociclador convencional con bloque de 96 pocillos.
CFX96:
Equipo de PCR a tiempo real y HRM con bloque de 96 pocillos.
Nanodrop:
Espectrofotómetro.
Bioanalyzer 2100:
Equipo de electroforesis microfluidica en chip.
Infinite F200 TECAM:
Fluorímetro.
Servicios Ofrecidos
1.- Cría y mantenimiento de cepas de ratones modificados genéticamente:
Diversas cepas (líneas) de ratón modificados genéticamente son producidas previa petición de los usuarios y para su uso en los proyectos de investigación, aprobados por el Comité Ético de Experimentación Animal. Se trata de cepas que por sus características genéticas especiales son difíciles de encontrar en las casas comerciales o que su valor hace inviable económicamente su adquisición continuada desde otros centros. Su cría se realiza en condiciones SPF (animales libres de patógenos especificados según el estándar de FELASA) con control sanitario periódico a través de un programa de centinelas.
La cría de estas colonias incluye la GESTION INTEGRAL DE LA COLONIA que garantiza la calidad sanitaria y genética de la línea:
- Control reproductivo informatizado.
- Programas de control sanitario.
- Control genético: genotipado.
2.- Mantenimiento de otros animales de laboratorio:
Se mantienen roedores y conejos procedentes de otras Casas comerciales de Cría y Suministro de animales de experimentación, adquiridos directamente para su utilización en procedimientos experimentales.
3.- Producción de anticuerpos policlonales y colaboración con el Servicio de Cultivos en la producción de anticuerpos monoclonales:
Inmunización, extracción de fluidos biológicos y otros órganos. Los procedimientos se realizan según los protocolos establecidos internacionalmente.
4.- Producción de fetos y neonatos de ratón a fecha determinada:
Establecimiento de cruces, programas de sincronización de celos, superovulación, etc., control de tapones vaginales, y cesáreas programadas.
5.- Realización de técnicas experimentales en roedores y conejos:
Todos los procedimientos se llevan a cabo con nivel de bioseguridad II.
- Administración de productos, inoculación de células y agentes infecciosos.
- Obtención de muestras, extracción de sangre y otros fluidos.
- Obtención de tejidos y órganos.
6.- Supervisión de los protocolos experimentales y realización de observaciones clínicas específicas.
- Programa de aclimatización y aprendizaje para los animales.
- Programa de enriquecimiento ambiental.
7.- Servicio de anestesia, analgesia y cuidados postoperatorios.
8.- Procedimientos quirúrgicos a medida.
Bajo la demanda de los usuarios, se desarrolla en la UEA protocolos quirúrgicos aprobados por el Comité Ético de Experimentación animal.
9.- Modelos animales precondicionados para estudios determinados.
Permite la obtención de modelos animales listos para ser usados:
- Modelos para estudios de alimentación (obesidad, diabetes, hipertensión, etc).
- Modelos de envejecimiento.
- Modelos obtenidos por manipulaciones quirúrgicas bajo demanda: modelos de exéresis (castración, ovariotomía, adrenalectomía, tiroparatiroidectomía, nefrectomía, etc).
10.- Servicio de eutanasia y necropsias.
11.- Unidad para Estudios de dolor.
12.- Unidad para Estudios de comportamiento.
13.- Rederivación de líneas mediante hicterectomía aséptica.
14.- Servicio de Formación del personal investigador:
Organización de Jornadas y Seminarios para la formación en el manejo y técnicas experimentales con roedores y conejos.
15.- Asesoramiento Técnico en Experimentación y Bienestar Animal.
Tarifas
Tarifa A: CSIC; Tarifa B: OPIs; Tarifa C: Privados
Tarifas válidas desde el día 1 de Marzo de 2024 salvo error tipográfico.
| Modalidad | Tarifa A | Tarifa B | Tarifa C |
|---|---|---|---|
| Secuenciación Sanger | |||
| Convencional | 5,37 | 7,65 | 8,38 |
| Electroforesis Capilar | |||
| Análisis Fragmentos | 2,51 | 3,53 | 3,87 |
| SHAPE Set up | 35,35 | 40,58 | 44,45 |
| SHAPE Reacción | 2,65 | 3,58 | 3,92 |
| Primer Extension Set up | 35,35 | 40,58 | 44,45 |
| Primer Extension Reacción | 2,65 | 3,58 | 3,92 |
| Agilent Bioanalyzer 2100 | |||
| Calidad RNA Std Sens/chip | 59,99 | 78,23 | 85,68 |
| DNA High Sens/chip | 105,97 | 136,40 | 149,39 |
| Purificación automática ácidos nucleicos | |||
| DNA genómico | 7,76 | 11,50 | 12,59 |
| RNA total | 13,02 | 17,32 | 18,96 |
| DNA plasmídico | 5,44 | 8,94 | 9,79 |
| DNA genómico heces | 13,06 | 20,21 | 22,13 |
| Tratamiento DNase I | 3,47 | 4,20 | 4,59 |
| Cuantificación fluorométrica de ácidos nucleicos | |||
| Qubit dsDNA HS | 1,07 | 1,82 | 2,00 |
| Qubit RNA HS | 1,10 | 1,86 | 2,04 |
| NGS MiSeq | |||
| Carrera V3 150 ciclos | 1612,51 | 1928,82 | 2112,52 |
| Carrera V3 600 ciclos | 2570,18 | 3038,93 | 3328,35 |
| Carrera V2 50 ciclos | 1451,79 | 1732,19 | 1897,17 |
| Carrera V2 300 ciclos | 1857,74 | 2199,92 | 2409,44 |
| Carrera V2 500 ciclos | 2089,12 | 2455,71 | 2689,59 |
| Carrera Nano 300 ciclos | 522,13 | 666,55 | 730,03 |
| Carrera Nano 500 ciclos | 624,66 | 779,89 | 854,17 |
| Carrera Micro 300 ciclos | 783,99 | 993,94 | 1088,60 |
| NGS NexSeq 500 | |||
| Carrera High Output 75 ciclos | 2576,81 | 2932,55 | 3211,84 |
| Carrera High Output 150 ciclos | 5029,13 | 5662,53 | 6201,82 |
| Carrera High Output 300 ciclos | 7898,49 | 8834,60 | 9675,99 |
| Carrera Mid Output 150 ciclos | 1920,09 | 2174,09 | 2381,14 |
| Carrera Mid Output 300 ciclos | 3089,45 | 3466,81 | 3796,98 |
| NGS Construcción librerías | |||
| Fragmentación DNA/RNA Covaris | 15,98 | 18,53 | 20,30 |
| Librería mRNA stranded | 109,63 | 140,98 | 154,41 |
| Librería RNA total | 188,43 | 247,81 | 271,41 |
| Librería small RNA | 107,08 | 157,88 | 172,92 |
| Librería DNA | 57,57 | 82,90 | 90,79 |
| Librería DNA Tagmentación | 96,47 | 126,43 | 138,48 |
| Librería Amplicones | 16,73 | 24,48 | 26,81 |
| QC librerías ddPCR | 79,05 | 126,97 | 139,06 |
| Bloqueo PCR | 0,79 | 1,34 | 1,47 |
| Bloqueo PCR | 1,87 | 2,72 | 2,98 |
| Secuenciación de célula única | |||
| SC 10X Chip | 568,54 | 704,99 | 772,14 |
| SC 10X GEMs | 3336,63 | 3849,91 | 4216,56 |
| SC 10X Librería | 191,78 | 252,33 | 276,36 |
| SC 10X VDJ | 57,26 | 102,72 | 112,50 |
| SC 10X Cell Plex | 264,48 | 312,09 | 341,81 |
| SC 10X FeatBar | 113,96 | 145,70 | 159,57 |
| SC Rhapsody Multiplexing | 231,34 | 275,53 | 301,77 |
| SC Rhapsody Abseq (no incluye conjugados) | 20,63 | 42,60 | 46,65 |
| SC Rhapsody Captura | 2033,26 | 2342,61 | 2565,72 |
| SC Rhapsody Librería WTA | 451,36 | 696,17 | 762,47 |
| SC Rhapsody Panel | 466,76 | 713,18 | 781,10 |
| Consultoría | |||
| Consultoría/hora | 0,03 | 39,53 | 43,29 |