Genomica

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El objetivo principal de la Unidad de Genómica del IPBLN es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica.

La UGIPBLN apuesta por la excelencia en la investigación biomédica. Por ello hemos establecido un sistema de gestión de la calidad y estamos involucrados en un proceso de certificación, con el fin de que nuestros servicios cumplan con los máximos estándares de calidad científica. Para saber más consulta nuestra Carta de Compromiso de Calidad:

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Objetivos
Instalaciones

Laboratorio de produccion de librerias NGS

Sala de secuenciadores NGS

Laboratorio de secuenciacion Sanger

Sala de real time PCR y digital PCR

Equipamiento

3130XL Genetic Analyzer:
Secuenciador 3130xl de Applied Biosystems de 16 capilares.

ABI 7000 SDS: 
Equipo de PCR a tiempo real con bloque de 96 pocillos.

COVARIS M220: 
Ultrasonicador focalizado para fragmentacion de moleculas

MiSeq:
Equipo de secuenciacion masiva low-throughput de tecnologia Illumina.

NextSeq 500:
Equipo de secuenciacion masiva high-throughput de tecnología Illumina

Qiacube:
Plataforma para la purificación automatizada de ácidos nucleicos.

Qubit:
Fluorímetro.

HT7900 Fast Real-Time PCR System: 
Equipo de PCR a tiempo real y estación de genotipado con bloques intercambiables de 384 pocillos y TLDAs.

Gene Amp 9700 PCR System: 
Termociclador convencional con bloque de 96 pocillos.

T-100 PCR:
Termociclador convencional con bloque de 96 pocillos.

CFX96:
Equipo de PCR a tiempo real y HRM con bloque de 96 pocillos.

Nanodrop: 
Espectrofotómetro.

Bioanalyzer 2100:
Equipo de electroforesis microfluidica en chip.

Infinite F200 TECAM:
Fluorímetro.

Servicios Ofrecidos

1.- Cría y mantenimiento de cepas de ratones modificados genéticamente:
Diversas cepas (líneas) de ratón modificados genéticamente son producidas previa petición de los usuarios y para su uso en los proyectos de investigación, aprobados por el Comité Ético de Experimentación Animal. Se trata de cepas que por sus características genéticas especiales son difíciles de encontrar en las casas comerciales o que su valor hace inviable económicamente su adquisición continuada desde otros centros. Su cría se realiza en condiciones SPF (animales libres de patógenos especificados según el estándar de FELASA) con control sanitario periódico a través de un programa de centinelas.
La cría de estas colonias incluye la GESTION INTEGRAL DE LA COLONIA que garantiza la calidad sanitaria y genética de la línea:

  • Control reproductivo informatizado.
  • Programas de control sanitario.
  • Control genético: genotipado.

2.- Mantenimiento de otros animales de laboratorio:
Se mantienen roedores y conejos procedentes de otras Casas comerciales de Cría y Suministro de animales de experimentación, adquiridos directamente para su utilización en procedimientos experimentales.

3.- Producción de anticuerpos policlonales y colaboración con el Servicio de Cultivos en la producción de anticuerpos monoclonales:
Inmunización, extracción de fluidos biológicos  y otros órganos. Los procedimientos se realizan según los protocolos establecidos internacionalmente.

4.- Producción de fetos y neonatos de ratón a  fecha determinada:
Establecimiento de cruces, programas de sincronización de celos, superovulación, etc., control de tapones vaginales, y cesáreas programadas.

5.- Realización de técnicas experimentales en roedores y conejos:
Todos los procedimientos se llevan a cabo con nivel de bioseguridad II.

  • Administración de productos, inoculación de células y agentes infecciosos.
  • Obtención de muestras, extracción de sangre y otros fluidos.
  • Obtención de tejidos y órganos.

6.- Supervisión de los protocolos experimentales y realización de observaciones clínicas específicas.

  • Programa de aclimatización y aprendizaje para los animales.
  • Programa de enriquecimiento ambiental.

7.- Servicio de anestesia, analgesia y cuidados postoperatorios.

8.- Procedimientos quirúrgicos a medida.
Bajo la demanda de los usuarios, se desarrolla en la UEA protocolos quirúrgicos aprobados por el Comité Ético de Experimentación animal.

9.- Modelos animales precondicionados para estudios determinados.
Permite la obtención de modelos animales listos para ser usados:

  • Modelos para estudios de alimentación (obesidad, diabetes, hipertensión, etc).
  • Modelos de envejecimiento.
  • Modelos obtenidos por manipulaciones quirúrgicas bajo demanda: modelos de exéresis (castración, ovariotomía, adrenalectomía, tiroparatiroidectomía, nefrectomía, etc).

10.- Servicio de eutanasia y necropsias.

11.- Unidad para Estudios de dolor.

12.- Unidad para Estudios de comportamiento.

13.- Rederivación de líneas mediante hicterectomía aséptica.

14.- Servicio de Formación del  personal investigador:
Organización de Jornadas y Seminarios para la formación en el manejo y técnicas experimentales con roedores y conejos.

15.- Asesoramiento Técnico en Experimentación y Bienestar Animal.

Tarifas

Tarifa A: CSIC; Tarifa B: OPIs; Tarifa C: Privados

Tarifas válidas desde el día 1 de Marzo de 2024 salvo error tipográfico.

Modalidad Tarifa A Tarifa B Tarifa C
Secuenciación Sanger
Convencional 5,37 7,65 8,38
Electroforesis Capilar
Análisis Fragmentos 2,51 3,53 3,87
SHAPE Set up 35,35 40,58 44,45
SHAPE Reacción 2,65 3,58 3,92
Primer Extension Set up 35,35 40,58 44,45
Primer Extension Reacción 2,65 3,58 3,92
Agilent Bioanalyzer 2100
Calidad RNA Std Sens/chip 59,99 78,23 85,68
DNA High Sens/chip 105,97 136,40 149,39
Purificación automática ácidos nucleicos
DNA genómico 7,76 11,50 12,59
RNA total 13,02 17,32 18,96
DNA plasmídico 5,44 8,94 9,79
DNA genómico heces 13,06 20,21 22,13
Tratamiento DNase I 3,47 4,20 4,59
Cuantificación fluorométrica de ácidos nucleicos
Qubit dsDNA HS 1,07 1,82 2,00
Qubit RNA HS 1,10 1,86 2,04
NGS MiSeq
Carrera V3 150 ciclos 1612,51 1928,82 2112,52
Carrera V3 600 ciclos 2570,18 3038,93 3328,35
Carrera V2 50 ciclos 1451,79 1732,19 1897,17
Carrera V2 300 ciclos 1857,74 2199,92 2409,44
Carrera V2 500 ciclos 2089,12 2455,71 2689,59
Carrera Nano 300 ciclos 522,13 666,55 730,03
Carrera Nano 500 ciclos 624,66 779,89 854,17
Carrera Micro 300 ciclos 783,99 993,94 1088,60
NGS NexSeq 500
Carrera High Output 75 ciclos 2576,81 2932,55 3211,84
Carrera High Output 150 ciclos 5029,13 5662,53 6201,82
Carrera High Output 300 ciclos 7898,49 8834,60 9675,99
Carrera Mid Output 150 ciclos 1920,09 2174,09 2381,14
Carrera Mid Output 300 ciclos 3089,45 3466,81 3796,98
NGS Construcción librerías
Fragmentación DNA/RNA Covaris 15,98 18,53 20,30
Librería mRNA stranded 109,63 140,98 154,41
Librería RNA total 188,43 247,81 271,41
Librería small RNA 107,08 157,88 172,92
Librería DNA 57,57 82,90 90,79
Librería DNA Tagmentación 96,47 126,43 138,48
Librería Amplicones 16,73 24,48 26,81
QC librerías ddPCR 79,05 126,97 139,06
Bloqueo PCR 0,79 1,34 1,47
Bloqueo PCR 1,87 2,72 2,98
Secuenciación de célula única
SC 10X Chip 568,54 704,99 772,14
SC 10X GEMs 3336,63 3849,91 4216,56
SC 10X Librería 191,78 252,33 276,36
SC 10X VDJ 57,26 102,72 112,50
SC 10X Cell Plex 264,48 312,09 341,81
SC 10X FeatBar 113,96 145,70 159,57
SC Rhapsody Multiplexing 231,34 275,53 301,77
SC Rhapsody Abseq (no incluye conjugados) 20,63 42,60 46,65
SC Rhapsody Captura 2033,26 2342,61 2565,72
SC Rhapsody Librería WTA 451,36 696,17 762,47
SC Rhapsody Panel 466,76 713,18 781,10
Consultoría
Consultoría/hora 0,03 39,53 43,29