Bioinformatica
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La unidad de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina Lopez-Neyra se dedica a dar soporte a los investigadores en sus análisis. Se centra principalmente en el análisis de datos, desarrollo personalizado de herramientas bioinformáticas, construir y mantener una infraestructura computacional científica.
- Análisis de Datos: Como parte de nuestro servicio, analizamos datos procedentes de cualquier tecnología genómica (Ej: microarrays, secuenciación masiva), proteómica (ej: iTraq)
- Infraestructura Computacional: Con el objetivo de poder analizar grandes cantidades de datos, la unidad se encarga de la creación y administración de una moderna infraestrucutra dedicada a la computación científica.
- Herramientas Bioinformaticas: Una parte importante dentro de la unidad, es el desarrollo de herramientas personalizadas que ayuden a analizar y entender y mostrar datos biológicos relevantes.
- Cursos: La formación en herramientas bioinformáticas, estadísticas u orientadas a la programación de tareas rutinarias es otro de nuestros objetivos.
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Servicios Ofrecidos
- Análisis de Datos: Como parte de nuestro servicio, analizamos datos procedentes de cualquier tecnología genómica (Ej: microarrays, secuenciación masiva), proteómica (ej: iTraq)
- Infraestructura Computacional: Con el objetivo de poder analizar grandes cantidades de datos, la unidad se encarga de la creación y administración de una moderna infraestrucutra dedicada a la computación científica.
- Herramientas Bioinformaticas: Una parte importante dentro de la unidad, es el desarrollo de herramientas personalizadas que ayuden a analizar y entender y mostrar datos biológicos relevantes.
- Cursos: La formación en herramientas bioinformáticas, estadísticas u orientadas a la programación de tareas rutinarias es otro de nuestros objetivos.
Publicaciones
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Tarifas
Las tarifas de la unidad de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina Lopez-Neyra para los usuario del CSIC (incluido el IPBLN), se pueden consultar en la intranet del csic. Un vez dentro de la intranet, selecciones aplicaciones corporativas y ahi aparecerá el catálogo de prestaciones. O puede probar a pinchar en este link .
Para el resto de instituciones (OPIs/Universidades o empresas), las tarifas actualmente vigentes son:
| Prestación | Precio (€/hora) | |
|---|---|---|
| OPI/AGE/Univ | Otros | |
| Análisis bioinformático de expresión diferencial de genes en microarrays | 43.20 | 47.31 |
| Análisis bioinformático de expresión génica diferencial y splicing en RNA-seq (NGS) | 43.20 | 47.31 |
| Análisis Bioinformático de expresión diferencia de microARNs | 43.20 | 47.31 |
| Análisis Bioinformático de interacción de regiones cromosómicas 4c ChIP | 43.20 | 47.31 |
| Ultrasecuenciación, Determinación de regiones enriquecidas en experimentos ChIP-seq | 43.20 | 47.31 |
| Análisis de la accesibilidad a la cromatina (ATAC-seq) | 43.20 | 47.31 |
| Detección de polimorfismos SNPs e INDELs en proyectos de Secuenciación de última generación | 43.20 | 47.31 |
| Análisis Bioinformático de expresión génica diferencial en célula única: scRNA-seq | 43.20 | 47.31 |
| Análisis de la accesibilidad a la cromatina en célula única scATAC-seq | 43.20 | 47.31 |
| Análisis de metagenómica de 16S, 23S, ITS, Shotgun o meta-transcriptómica | 43.20 | 47.31 |
| Ensamblaje de novo de genomas con secuencias cortas, así como largas | 43.20 | 47.31 |
| Cálculo de estructura secundaria y estabilidad en RNA | 43.20 | 47.31 |
| Asesoramiento en análisis y en diseño experimental | 43.20 | 47.31 |
| Asesoramiento y formación para el desarrollo de cálculos de computación científica | 43.20 | 47.31 |
| Trabajo con secuencias de NGS en bases de datos como SRA, GEO y otros | 43.20 | 47.31 |
| Desarrollo de Software científico a medida | 43.20 | 47.31 |